美吉生物

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STR分型檢測 技術參數 常見問題 留言咨詢

       短串聯重復序列(short tandem repeat,STR),它廣泛并均勻地存在于真核生物基因組中,一般由一個長2~6bp的核心序列經多次串聯重復排列而成,重復次數大多在10~60次之間。個體間核心序列的重復次數呈高度變異性,構成了STR的遺傳多態性。由于STR具有分布廣泛均勻、多態性豐富、信息量大、檢測簡便等優點,已廣泛應用于遺傳圖譜繪制、基因定位、法醫鑒定、遺傳病診斷等諸多領域。

       美吉生物可為您提供特定區域掃描、人致病基因定位(全基因組掃描)兩種STR分型檢測服務。


特定區域掃描

       美吉生物可根據合作伙伴指定的染色體區域尋找微衛星標記,進行定點掃描。


美吉優勢:

       1、可以提供熒光引物的合成。

       2、實驗周期短:正常情況下,3~4天就可以出結果。

       3、結題報告數據明顯,通過表格和峰圖可以清楚的看到片段大小、豐度、純合雜合等分型信息。


技術路線:

結題報告含有兩種文件: 


1、峰圖文件:


2、Excel表格文件:


溫馨提示:

       1. 送樣要求,PCR產物或基因組DNA:濃度≥50ng/μl,總體積≥20μl;新鮮組織樣品:總量≥100mg的新鮮組織樣品或1~2ml血液樣品;
       2. 送樣時,請注意避光保存,同時在訂單上標注好是STR樣本;
       3.我們默認使用的內參為ROX500和LIZ500,如需使用其他內參,請自行提供;
       4.建議使用Fam、Hex、Tamra三種熒光標記;
       5.為盡量避免多種熒光信號的相互干擾,不建議同管檢測使用的熒光多于2種;多種熒光同管檢測,PCR產物大小需相差50bp以上;

(1)你們是怎么區分出我送的未知熒光呢?

       我們使用ROX500作為紅色內標時,可以鑒別出藍色熒光和綠色熒光;LIZ500作為橙色內標時,四種熒光都可以鑒別的出來。


(2)STR檢測用的儀器是什么?名字與型號,廠家, 最多能測多少個bp?

       我們使用的儀器是ABI3730 Analyzer (美國),最多能測500bp。


(3)上樣量(分子量內標、 甲酰胺及PCR產物各需要多少)?

       先對PCR產物進行純化,隨后取1ulPCR產物和10ul的內標[加入1000 ul HIDI和5ul ROX500/LIZ500,震蕩、混勻(96個樣品用量)]進行上樣。


(4)公司能否提供Genemapper 4.0軟件?

       這個軟件是正版軟件,不能隨意安裝,不便提供。另外老師您可以在發送給您結果的郵件中下載分析軟件 Genemarker(在英文操作環境下進行)。


(5)其中Allele,Size,Height,Peak Area, Data Point分別代表什么?如何解釋?

       Allele:Displays the label of the allele according to the Label settings of the analysis method
       Size:Displays the calculated size (in bp) of the associated peak.
       Height:Displays the height (in RFU) of the associated peak.
       Peak Area:Displays the calculated area underneath the associated peak.
       Data Point :Displays the data point that defines the center of the associated peak in the sample data

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